|
課程名稱 |
生物資訊學軟體應用
APPLICATION OF BIOINFOMATICS PROGRAMS |
|
開課學期 |
96-2 |
|
授課對象 |
學程 系統生物與生物資訊學程 |
|
授課教師 |
林恩仲 |
|
課號 |
AniSci7026 |
|
課程識別碼 |
626 M1620 |
|
班次 |
|
|
學分 |
3 |
|
全/半年 |
半年 |
|
必/選修 |
選修 |
|
上課時間 |
星期四6,7,8(13:20~16:20) |
|
上課地點 |
畜一 |
|
備註 |
總人數上限：30人 |
|
|
|
|
課程簡介影片 |
|
|
核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
|
課程大綱
|
|
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
|
|
課程概述 |
教導學生(以研究所為主)使用基因體及蛋白質體研究上所需的應用程式，實際上機操作並配合資料進行運算及分析結果，並介紹如何使用Perl程式整合需要的程式。 |
|
課程目標 |
訓練學生使用及整合網路上免費之公開生物資學相關軟體，實際操作及配合其研究興趣建立個人的程式庫。 |
|
課程要求 |
需已修過生物資訊學或其導論課程，本課程以研究生為主，大學部學生必須經過上課教師之同意，因電腦數量有限，本課程人數最多為24人。 |
|
預期每週課後學習時數 |
|
|
Office Hours |
|
|
指定閱讀 |
|
|
參考書目 |
1.Baxevanis, A. D. and Francis Ouellette, B. F. (ed.) 2005. Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. 3rd Ed. Published by: John Wiley & Son, Inc., NY, U.S.A.
2.Mount, D. W. 2004. Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis. 2nd Ed. Published by: Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, U.S.A.
3.Tisdall, J. Beginning Perl for Bioinformatics. 2004. Published by O’Reilly. |
|
評量方式
(僅供參考) |
|
No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
|
1. |
期中報告 |
20% |
|
2. |
期末報告 |
30% |
|
3. |
口頭報告 |
20% |
期中與期末皆有口頭報告 |
4. |
平時作業 |
30% |
|
|
|
週次 |
日期 |
單元主題 |
|
第1週 |
2/21 |
生物資訊學與計算工具的簡介 |
|
第2週 |
2/28 |
和平紀念日(放假一天) |
|
第3週 |
3/06 |
序列比對 |
|
第4週 |
3/13 |
序列分析 (I) |
|
第5週 |
3/20 |
序列分析 (II) |
|
第6週 |
3/27 |
基因預測 (I) |
|
第7週 |
4/03 |
基因預測 (II) |
|
第8週 |
4/10 |
晶片資料分析 (I) |
|
第9週 |
4/17 |
晶片資料分析 (II) |
|
第10週 |
4/24 |
期中報告 |
|
第11週 |
5/01 |
蛋白質預測 (I) |
|
第12週 |
5/08 |
蛋白質預測 (II) |
|
第13週 |
5/15 |
蛋白質預測 (III) |
|
第14週 |
5/22 |
Perl介紹與實作 (I) |
|
第15週 |
5/29 |
Perl介紹與實作 (II) |
|
第16週 |
6/05 |
Perl介紹與實作 (III) |
|
第17週 |
6/12 |
期末報告 (I) |
|
第18週 |
6/19 |
期末報告 (II) |
|